搭建東南亞跨境電商網站時，選擇馬來西亞服務器的配置應考慮以下關鍵因素：

1、服務器類型：中小型電商網站可以選擇虛擬私人服務器 (VPS)，大型或高流量網站則適合專用服務器。

2、地理位置：選擇馬來西亞或其周邊地區的數據中心，以確保訪問速度和降低延遲。

3、CPU核心數：根據網站流量和并發用戶數，至少需要4核心CPU，推薦配置為8核心。

4、RAM大小：至少8GB RAM起，對于更高的并發處理能力，推薦16GB RAM。

5、存儲空間：推薦使用SSD硬盤，根據內容和用戶上傳量確定容量，起始配置為100GB SSD，推薦配置為250GB SSD。

6、帶寬：確保足夠的帶寬支持用戶需求，起始配置為10TB，推薦配置為無限帶寬。

7、備份和恢復：服務提供商應提供定期備份選項，推薦配置包括實時備份。

8、安全性：選擇具備防火墻、DDoS保護等安全措施的服務器，推薦配置包括高級防火墻與DDoS保護。

9、可擴展性：選擇可以輕松升級資源的服務器配置，推薦配置為自動資源管理。

10、技術支持：確保服務提供商提供24/7技術支持，推薦配置為優先技術支持。

此外，還應考慮服務器的訪問速度、穩定性、安全性能以及技術支持的完善性。例如，選擇馬來西亞頂級數據機房的服務器，并確保有大帶寬保障快速訪問。同時，確保服務器有99%以上的穩定性運行保障，并具備完善的數據備份系統和安全防護體系。最后，選擇有資質、售后技術完善的主機商，以保障及時解決使用過程中的問題。